Если выбрать пункт Свойства в контекстном меню диска в окне Компьютер и перейти на вкладку Сервис, то там присутствует возможность запуска некоторых дисковых утилит. Можно прописать туда свои программы вместо установленных по умолчанию. Откройте раздел HKLM\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\MyComputer. В этом разделе уже могут находиться некоторые подразделы, отвечающие за дисковые утилиты. Если их нет, то создайте их сами и в значениях по умолчанию этих разделов задайте путь к вашему приложению.
Чтобы вернуться к прежнему состоянию, нужно либо установить значения по умолчанию (приводятся выше), либо удалить эти подразделы.